Μετά το σκάνδαλο που είδε το φως της δημοσιότητας για το Α.Π.Θ, σειρά είχε το Πανεπιστήμιο του Αιγαίου, όπου τοπική εφημερίδα αναφέρει ότι γίνεται κατάχρηση χρημάτων και ευρωπαϊκών κονδυλίων από τους διοικητικούς υπαλλήλους του τμήματος.
Σύμφωνα με την εφημερίδα «Τα Νέα της Λέσβου» και το άρθρο της Ανθής Παζιάνου, διοικητικοί υπάλληλοι του Πανεπιστημίου Αιγαίου καταχράζονται ευρωπαϊκά κονδύλια, απολαμβάνοντας παχυλές αμοιβές, σε μια περίοδο προβλημάτων λειτουργίας και λιτότητας του ιδρύματος. Τα για ευρωπαϊκά προγράμματα που δίνονται στο Πανεπιστήμιο προορίζονται για έρευνα, θερινά σχολεία, εξ’ αποστάσεως διδασκαλία και μεταπτυχιακά. Αντί αυτού, τα στελέχη που διαχειρίζονται τα οικονομικά του ιδρύματος παρουσιάζουν εικονικές υποτροφίες, προσλήψεις εποχιακού προσωπικού και συμβάσεις έργου μιας και ο ελεγκτικός μηχανισμός απουσιάζει.
Σύμφωνα με το δημοσίευμα, τα ποσά που καταχράζονται τα υψηλόβαθμα στελέχη ανέρχονται σε 40,000€ από κάθε ευρωπαϊκό κονδύλιο καθώς και άσκοπες δαπάνες από τον Πανεπιστημιακό προϋπολογισμό. Τέλος, η στάση του Πρύτανη επιβεβαιώνει το δημοσίευμα, αφού έκλεισε το τηλέφωνο στην δημοσιογράφο χωρίς να πάρει θέση για ένα τόσο σοβαρό θέμα.