Μεγάλο πρόβλημα στον τομέα της σίτισης φοιτητών αντιμετωπίζει το Πανεπιστήμιο Αιγαίου. Συγκεκριμένα, στην Σάμο, το Πανεπιστήμιο Αιγαίου θα σιτίσει μόνο 321 φοιτητές. Μόνο ένας στους τρεις φοιτητές δικαιούται δωρεάν σίτιση ενώ οι υπόλοιποι φοιτητές καλούνται να καταβάλουν το πόσο των 2€ για κάθε γεύμα η δείπνο η 3€ για γεύμα και δείπνο μαζί.
Παρόλο που οι αιτήσεις για σίτιση έχουν ως κατώτερο όριο τις 40,000€, το Πανεπιστήμιο Αιγαίου αδυνατεί να ανταπεξέλθει στον αριθμό των φοιτητών. Μέχρι πρότινος, στο Πανεπιστήμιο Αιγαίου σιτιζόντουσαν όλοι οι φοιτητές ανεξάρτητου εισοδήματος. Η μεγάλη αύξηση των φοιτητών τα δύο τελευταία έτη, λόγω παύσης των μεταγραφών, αιφνίδιασε το Πανεπιστήμιο, βρίσκοντας το απροετοίμαστο σε πολλά θέματα (εστίες, σίτιση, υποδομές). Στην Σάμο στεγάζονται στις εστίες 300 φοιτητές. Πολύ πιθανό μόνο αυτοί να σιτίζονται δωρεάν, εφόσον καλύπτουν τον μέγιστο αριθμό φοιτητών που μπορεί να καλύψει το ίδρυμα.